Bakterien sind nicht grundsätzlich negativ zu sehen. Im Teich und auch im Teichfilter spielen sie sogar eine enorm wichtige Rolle bei den biologischen Abbauprozessen bzw. der Nitrifikation.
Die die Teichbiologie unterstützenden Bakterien („aerobe“ Bakterien) brauchen für ihre Existenz unbedingt Sauerstoff. Geht dieser aus, sterben diese Bakterien ab, belasten das Teichwasser zusätzlich mit ihren Zersetzungsprodukten und die „anaeroben“ Bakterien beginnen ihr für den Teich schädliches Werk (Eutrophierung).